（一）办公室（应急办）
（二）党委办公室（工会）
（三）人事部（纪检监察室）
（四）财务部
（五）业务管理部
（六）质量管理部（药品化妆品抽检监测秘书处）
（七）监督抽样办公室
（八）培训部
（九）信息统计部
（十）科研管理部
（十一）食品药品技术研究中心
（十二）中药检测室
（十三）化学药品检测室
（十四）抗生素药品检测室
（十五）化妆品检测室
（十六）药品包装材料及辅料检测室
（十七）生物制品疫苗批签发检测室
（十八）微生物检测室
（十九）安全评价研究室
（二十）沣西保障综合部
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